Mạc Mậu Hợp (1560–1592), là con trai của Mạc Tuyên Tông Mạc Phúc Nguyên, lên ngôi hoàng đế triều Mạc năm 1562 khi mới 2 tuổi, là vị vua trị vì lâu nhất và cũng là vị vua cuối cùng của nhà Mạc tại Thăng Long.
Trong những năm đầu, do vua còn nhỏ, triều chính do các thân vương như Khiêm vương Mạc Kính Điển phụ chính, duy trì được thế cân bằng với lực lượng Lê - Trịnh ở phía Nam. Khi trưởng thành và tự cầm quyền, Mạc Mậu Hợp dần sa vào ăn chơi hưởng lạc, lơ là chính sự, khiến lực lượng nhà Mạc suy yếu.
Năm 1592, quân Lê - Trịnh do Trịnh Tùng chỉ huy tấn công mạnh mẽ, đánh chiếm kinh thành Thăng Long. Mạc Mậu Hợp bỏ chạy nhưng bị bắt, sau đó bị xử tử.
Sự sụp đổ của Mạc Mậu Hợp chấm dứt 65 năm tồn tại của triều Mạc tại Thăng Long. Ông được lịch sử ghi nhận là vị vua cuối cùng của dòng chính nhà Mạc, con cháu họ Mạc sau đó phải rút lên vùng Cao Bằng, duy trì thế lực cát cứ thêm nhiều thập kỷ.